Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Msx2Q03358 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms