Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacna1sQ02789 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms