Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Gjb4Q02738 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gjb4Q02738 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 935.5 ms