Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snai1Q02085 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms