Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Ascl1Q02067 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms