Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
PrcdQ00LT2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms