Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gjb2Q00977 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gjb2Q00977 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms