Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Apoa1Q00623 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Apoa1Q00623 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms