Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Pax8Q00288 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms