Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Smarcc1P97496 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Smarcc1P97496 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms