Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Pitx2P97474 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Pitx2P97474 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms