Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Mesp1P97309 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Mesp1P97309 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Mesp1P97309 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Mesp1P97309 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Mesp1P97309 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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Mesp1P97309 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Mesp1P97309 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms