Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cbx1P83917 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cbx1P83917 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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