Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Gbx1P82976 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms