Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx1P80205 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx1P80205 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Otx1P80205 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Otx1P80205 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms