Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tp53bp1P70399 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tp53bp1P70399 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tp53bp1P70399 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tp53bp1P70399 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tp53bp1P70399 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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