Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Usp9xP70398 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Usp9xP70398 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms