Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Vamp7P70280 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Vamp7P70280 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms