Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
RhobP62746 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
RhobP62746 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RhobP62746 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RhobP62746 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RhobP62746 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RhobP62746 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RhobP62746 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RhobP62746 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
RhobP62746 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RhobP62746 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
RhobP62746 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
RhobP62746 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
RhobP62746 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms