Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rps11P62281 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms