Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Lmo4P61969 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms