Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rhbdl3P58873 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms