Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Snrpa1P57784 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrpa1P57784 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms