Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Sh3bp1P55194 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms