Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VdrP48281 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VdrP48281 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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VdrP48281 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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VdrP48281 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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VdrP48281 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
VdrP48281 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VdrP48281 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VdrP48281 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VdrP48281 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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VdrP48281 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VdrP48281 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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VdrP48281 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VdrP48281 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VdrP48281 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
VdrP48281 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
VdrP48281 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
VdrP48281 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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