Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PtgfrP43117 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms