Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Upk2P38575 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms