Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprkP35822 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms