Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usp4P35123 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usp4P35123 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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