Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Apoc1P34928 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Apoc1P34928 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms