Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Hoxc5P32043 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms