Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
VtnP29788 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
VtnP29788 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
VtnP29788 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
VtnP29788 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
VtnP29788 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
VtnP29788 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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