Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pde6aP27664 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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