Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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PdgfraP26618 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PdgfraP26618 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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