Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Defa-rs1P17533 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Defa-rs1P17533 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Defa-rs1P17533 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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