Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Sptan1P16546 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sptan1P16546 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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