Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RhoP15409 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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RhoP15409 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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RhoP15409 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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RhoP15409 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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RhoP15409 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
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RhoP15409 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
RhoP15409 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
RhoP15409 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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