Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
PolP10400 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
PolP10400 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PolP10400 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PolP10400 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PolP10400 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PolP10400 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PolP10400 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PolP10400 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PolP10400 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PolP10400 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PolP10400 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
PolP10400 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms