Protein–RNA interactions for Protein: P0CG49

Ubb, Polyubiquitin-B, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbbP0CG49 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
UbbP0CG49 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms