Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxb7P09024 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms