Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
TtrP07309 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
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TtrP07309 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
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TtrP07309 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
TtrP07309 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
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