Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01660 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01660 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01660 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P01660 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P01660 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01660 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
P01660 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms