Protein–RNA interactions for Protein: P01643

Ig kappa chain V-V region MOPC 173, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01643 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01643 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01643 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01643 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms