Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
E2f6O54917 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
E2f6O54917 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E2f6O54917 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E2f6O54917 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms