Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
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Sp100O35892 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Sp100O35892 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Sp100O35892 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sp100O35892 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sp100O35892 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms