Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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Clk2O35491 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Clk2O35491 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Clk2O35491 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Clk2O35491 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Clk2O35491 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Clk2O35491 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clk2O35491 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Clk2O35491 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Clk2O35491 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Clk2O35491 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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