Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20878L7N244 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms