Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Gm5849J3QPE5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Gm5849J3QPE5 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm5849J3QPE5 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm5849J3QPE5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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Gm5849J3QPE5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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