Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Smim18J3QNP2 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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