Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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Ccdc180J3QNE4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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Ccdc180J3QNE4 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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Ccdc180J3QNE4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
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Ccdc180J3QNE4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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Ccdc180J3QNE4 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc180J3QNE4 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc180J3QNE4 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc180J3QNE4 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc180J3QNE4 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc180J3QNE4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
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